距离上一部已经多年，黑衣人组织因经费削减几乎解散。新人探员M（女）通过自学外星语考进组织，她的搭档H是个只会用记忆消除棒偷懒的老油条。两人调查一桩看似普通的外星人失踪案，却发现外星虫族已经伪装成多名国会议员，企图通过一项“允许外星人公开居住”的法案，实际是为大规模入侵铺路。M和H从纽约追到51区，用各种复古黑科技作战。最终H选择牺牲自己引爆飞船，M继承了他的代号。片尾彩蛋：H在外星医院醒来，说“我就知道你会回来”。
重启质量惊喜！新老搭档化学反应不输前作。笑点密集且紧跟时代（外星人直播带货）。女性探员M的塑造独立帅气不依附。
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当幻影战队的纳米装甲被黑客控制，队长必须用意志对抗系统，阻止战友屠杀平民。
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